Difüzyon: Hidrojenin diğer gaz yakıtlara göre çok daha yüksek olan hava içinde yayılma katsayısı (0,61 cm2/s), emniyet acısından önemli bir sorun oluşturur. Ayrıca kağıt, kumaş, kauçuk gibi malzemelerden geçebilmesi, platin, demir, çelik gibi metallere nüfuz etmesi yakıt deposu ve nakil hatlarının kırılganlığını artırmaktadır. Yine yüksek difüzyon özelliği nedeniyle depolama ve nakil hatlarında kaçak sorunları ortaya çıkabilmektedir.