İskelet kasının glukoz taşıma protein sayısı ve protein etkinliği artar.
Kasların karbonhidrat (glikojen) kullanım kapasiteleri artmaktadır. Antrenmanın, glikojeni iskelet kasında yıkımını artırmanın etkisinin yanı sıra, kaslardaki glikojen depolarında da artış sağlar. Bu ise antrenman ile ilişkili glikojen yapım ve yıkımında görev alan enzimlerin artmasına sebep olur.
Dayanıklılık antrenmanları ile iskelet kasında yağların kullanım kapasitesi de artmaktadır.
Antrenmana bağlı olarak kasların aerobik ortamda glikojen kullanım artışının yanı sıra yağların yıkımını da artırarak ATP üretim kapasiteleri de artar. Bunun sebepleri ise iskelet kaslarına kan akımının artması, yağları parçalayan enzim aktivite düzeylerindeki artıştır. Yağlar sporcuların dayanıklılığı için önemli enerji kaynağı olması sebebiyle, enerji kaynağı olarak yağları kullanım kapasitesindeki artış da dayanıklılık performansının geliştirilmesinde çok önemlidir. Kasların dayanıklılık antrenmanları ile yağları kullanım kapasitelerindeki artış; kas içerisindeki depo trigliserit miktarındaki ve yağ dokularından bırakılan serbest yağ asit miktarındaki artış ile gerçekleştirilir.
Dayanıklılık antrenmanları ile meydana gelen diğer önemli adaptasyonlardan birisi de, kas liflerinin etrafındaki kılcal damar (kapiller) sayısındaki artıştır.
Aerobik antrenmanlar, kas liflerindeki enerji üretimini artıran mitokondrideki fonksiyonlarda da değişikliklere sebep olur.
Aerobik antrenmanlar sonucunda, aerobik enerji sisteminin farklı aşamalarındaki enzim miktarında ve enzimlerin aktivite seviyelerinde de artış gerçekleşir.