Kümeleme analizinde birim ya da değişkenler arasındaki uzaklıkları hesaplamak için en sık kullanılan uzaklık ölçüsü Öklid uzaklığıdır. Bu uzaklık ölçüsü dışında birimler ya da değişkenler arasındaki uzaklık değerlerinden faydalanarak kümelerin oluşturulmasında kullanılan farklı uzaklık ölçüleri de vardır. Bunlar; Karesel Öklid uzaklığı, Pearson ve karesel Pearson uzaklığı, Manhattan (City-Blok) Uzaklığı, Korelasyon katsayısı ve korelasyon uzaklığı, Açısal uzaklık (cosine measure), Binary Öklid uzaklığı, Gamma benzerlik ölçüsü, Jaccard benzerlik ölçüsü, Minkowski uzaklığı, Mahalonobis uzaklığı, Hotelling T2 Uzaklığı, Canberra Uzaklık ölçüsüdür.