Yönetimin ikinci fonksiyonu örgütlemedir.

Örgütleme süreci, gerekli işleri tanımlamak, yapıyı oluşturmak ve görev, yetki ve sorumlulukları belirleme faaliyetlerinden oluşmaktadır.

Örgütlemenin aşamaları;

• İşlerin tanımlanması,
• İşlerin bölümlere ayrılması,
• Örgütsel yapının kurulması,
• Görev, yetki ve sorumluluklarının belirlenmesi,
• Örgüt şemaları ve örgüt el kitaplarının hazırlanmasıdır.

Sağlık hizmetlerinin diğer toplumsal alanlardan ayırıcı özelliği; hizmetin bu alanda eğitilmiş ve özelleşmiş elemanlar ile belli kurumlar tarafından; sağlığın sürdürülmesi veya tedavi edilmesi amacıyla yürütülen hizmetlerden oluşmasıdır.

Sağlık hizmetleri dört ana grupta toplanmaktadır. Bunlar;

• Koruyucu sağlık hizmetleri,
• Tedavi edici sağlık hizmetleri,
• Rehabilite edici sağlık hizmetleri ve
• Sağlığın geliştirilmesi hizmetleridir.

Sağlık kurumlarında finansal işlerin organize edilerek yürütülmesi yani finansal örgütlenme; sağlık kurumunun mülkiyetine, türüne ve büyüklüğüne göre farklılık göstermektedir.

Finansal örgütlenmede yer alan birimlerin sahip olduğu benzer özellikler;

• Tahsilât ve ödeme işlemlerinin farklı birimler tarafından yürütülmektedir, 
• Muhasebe birimi,
• Maaş–tahakkuk birimi,
• Bütçe birimi ve
• Vezne birimi bulunmadır.

Türkiye sağlık sisteminin organizasyonel yapısı; 

• Politika Geliştirilmesi
• Yönetim
• Sağlık Hizmetleri Finansmanı
• Sağlık Hizmetleri Sunumu'ndan oluşmaktadır.

Türkiye sağlık sistemi organizasyonel yapısı altında yer alan yönetim kısmında;

• Sağlık Bakanlığı
• İl Sağlık Müdürlükleri bulunmaktadır.

Sağlık sisteminin genel örgüt yapısı içinde sağlık kurumlarındaki finansal örgütlenmeyi şekillendiren üç temel unsur bulunmaktadır. Bunlar;

• Sağlık kurumunda uygulanan bütçe türü,
• Sağlık kurumunun büyüklüğü ve
• Geri ödeme kurumlarının sağlık hizmeti bedelini ödeme yöntemidir.

Türkiye sağlık sistemi organizasyonel yapısı altında yer alan sağlık hizmetleri finasmanı kısmında;

• Maliye Bakanlığı
• Sosyal Güvenlik Kurumu
• Özel Sigorta Şirketleri
• Cepten ödemeler yer almaktadır.

Sağlık Bakanlığı ve Milli Savunma Bakanlığına bağlı sağlık kurumlarında genel bütçe uygulanmaktadır.

Üniversitelere ait sağlık kurumlarında özel bütçe uygulanmaktadır.

Sağlık Bakanlığının görevi; herkesin bedenî, zihnî ve sosyal bakımdan tam bir iyilik hâli içinde hayatını sürdürmesini sağlamaktır.

Sağlık Bakanlığında hizmet birimleri arasında yer alan Strateji Geliştirme Başkanlığı hem genel bütçe hem de döner sermaye bütçesi ile ilgilenmektedir.

Sağlık bakanlığının sahip olduğu bağlı kuruluşlar

• Türkiye Kamu Hastaneleri Kurumu,
• Türkiye Halk Sağlığı Kurumu
• Türkiye İlaç ve Tıbbî Cihaz Kurumu ve
• Türkiye Hudut ve Sahiller Sağlık Genel Müdürlüğü'dür.

Türkiye Kamu Hastaneleri Kurumu; Sağlık Bakanlığının politika ve hedeflerine uygun olarak, ikinci ve üçüncü basamak sağlık hizmetlerini vermek üzere hastanelerin, ağız ve diş sağlığı merkezlerinin ve benzeri sağlık kuruluşlarının açılması, işletilmesi, faaliyetlerinin izlenmesi, değerlendirilmesi ve denetlenmesi, bu hastanelerde her türlü koruyucu, teşhis, tedavi ve rehabilite edici sağlık hizmetlerinin verilmesini sağlamakla görevli kurumdur.

Türkiye Kamu Hastaneleri Kurumunun taşra teşkilatı Kamu Hastane Birliklerinden oluşmaktadır.

Kamu Hastane birliklerinin en üst karar ve yürütme organı genel sekreterliktir.

Üniversite hastanelerinin organizasyon yapısına ait ortak yönler;

• Hepsi araştırma ve uygulama merkezi olarak kurulurlar,
• Hepsinin ayrı yönergeleri ya da yönetmelikleri vardır.
• Genellikle Rektör tarafından atanan başhekim (genel direktör) tarafından yönetilirler.
• Tıp fakültelerinin etkisi fazladır ve bazıları fiilen tıp fakültesi dekanı tarafından yönetilmektedir.
• İdari, mali ve teknik hizmetler üniversite genel sekreteri ve başhekime bağlı çalışan başmüdür
  tarafından organize edilir.