Prader Willi Sendromu’nun en belirgin özellikleri doğum öncesi dönemde azalan fetüs hareketleri, beslenme zorluğu, erken çocuklukta gelişen obezite, hafif ve orta zihinsel yetersizlik, küçük cinsel organ, küçük el ve ayaklar, kısa boy, duygusal bozukluk, kaslarda güçsüzlük ve yetersizliktir. Prader Willi Sendromu’na sahip bireylerin en belirgin özelliklerinden birisi erken çocukluk döneminde çıkan ve yaşam boyu süren bir iştaha sahiptirler. Dolayısıyla obezite olma olasılıkları oldukça yüksektir. Aşırı şişmanlıkla birlikte kalp, akciğer, şeker hastalıkları, solunum yetmezlikleri ortaya çıkabilmektedir. Hatta bazı durumlarda ölümle sonuçlanabilir.