Bir coğrafi bilgi sistemi yazılımının temel fonksiyonları arasında sayısallaştırma, değişiklik yapma, topoloji oluşturma, farklı formatlarda saklama, öznitelik belirleme, veri depolama, modelleme, öznitelik sorgulama, nesne tabanlı veritabanı oluşturma, ölçme işlemlerini gerçekleştirme, farklı veri katmanlarını çakıştırma, mekânsal analizler yapma, görüntüleme vb. sayılabilir. Görüldüğü üzere A, B, D ve E seçeneklerinde yer alan ifadeler doğru iken, C seçeneğinde yer alan istatistiki analizler yapma coğrafi bilgi sistemlerinin temel fonksiyonları arasında yer almaz.