Bazı kamu hizmetlerinde performans bütçeyi tam anlamıyla uygulayabilmenin
çok zor hatta olanaksız olması

Performans bütçe hazırlanmasının klasik bütçeye göre daha pahalı bir sistem olması

Bazı performans ölçülerinin uygun olmaması veya yanıltıcı olması

Performans ölçülerinin kamu yöneticileri tarafından etkilenebilir olması

Devletin katlandığı maliyete değecek bir sosyal fayda ortaya çıkıp çıkmadığını belirleyememesi