Kıbrıs sorunu konusunda da, Annan Planı etrafındaki görüşmelerde, Denktaş’ın
ve ona tabi olan Türk hükûmetinin katı tutumu sürmüştür. Sonunda, daha sonra
adadaki 24 Nisan 2004 referandumlarının gösterdiği gibi, asıl Rum tarafı olumsuz
yaklaşım sahibi iken, KKTC Cumhurbaşkanı Denktaş, 2002 AB Kopenhag Zirvesinde, Annan Planı’nı müzakere sözü vermekten kaçınarak, Rum tarafının planla ilgili referanduma AB üyeliğini garantiledikten sonra gitmesine imkân tanımıştır. Bu yüzden, 2002 sonunda iktidara gelen Adalet ve Kalkınma Partisi hükûmeti hemen sonra Kıbrıs politikamızda köklü bir değişiklik yapmaya girişmiş, ancak, Kopenhag Zirvesi’nde Denktaş’ı izlemesi nedeniyle Güney Kıbrıs Rum yönetiminin 24 Nisan referandumunda Annan Planı’nı reddetmesine rağmen Kıbrıs Cumhuriyeti olarak Avrupa Birliği üyesi olmasını engelleyememiştir. Kıbrıslı Türklerin “evet”i yetersiz kalmıştır. Her şeye rağmen bu “evet” dışişlerinin yükünü biraz hafifletmiş, Türk diplomatları uluslararası platformlarda Kıbrıs konusunda daima “haksız” ve “uzlaşmaz” görünmenin verdiği eziklikten bir ölçüde kurtulmuştur