Mandela’nın emekli olmasından sonra iktidara gelen Thabo Mbeki, bir yandan kendisinden önceki yapılan hataları tekrar yapmamak ve bir yandan da tutarlı bir dış politika yaklaşımının temellerini atmak için işe koyuldu . Mbeki’nin başkanlığının birinci dönemini ifade iden 1999-2004 yılları arasını, Güney Afrika dış politikası için telafi dönemi olarak adlandırmak mümkündür.