İlgili yönetmelik hükümleri çerçevesinde, gıda işletmelerinin denetim ve kontrolleri Tarım ve Orman Bakanlığı’nca eğitim verilerek yetkilendirilen gıda denetçisi tarafından yapılır. Denetim ve kontroller; kontrol programları ile çok yıllık ulusal kontrol planlarının yanı sıra şüphe, şikayet, inceleme, izlenebilirliğin sağlanması, izleme, gözetim ve tetkik amaçları ile de gerçekleştirilir.  Denetleme sırasında gıda işletmecisi ve çalışan personel ile görüşme yapılabilir. Denetleme gıda denetçisinin başkanlığında yardımcı denetim elemanından oluşan en az iki kişilik ekip tarafından yapılır.