Gıda Üretimin zincirinin tüm aşamalarında, 5179 Sayılı Kanun’a göre; denetim ve kontrollerini koordine etmek, AB’ye uyum çalışması çerçevesinde ülke genelinde etkin bir kontrol sistemi oluşturarak kaliteli ve güvenli gıda arzını sağlamak; AB Hızlı Alarm Sistemine ülkemiz alarm sisteminin bağlanabilmesini ve etkin bir şekilde işletilebilmesini sağlayarak taşra teşkilatı, laboratuvarlar ve ilgili kurum/ kuruluşlar arasında ulusal bir network sistemini kurmak ve işletmek; ihracattan geri dönen ürünlere yönelik acil tedbirlerin alınması için bağlı taşra teşkilatlarını görevlendirmek, yönlendirmek, ve koordinasyonunu sağlamak Yurt içi Gıda Kontrol ve Beslenme Şube Müdürlüğünün görevlerindendir.