Dahilde işleme rejimi şartlı muafiyet sistemi ve geri ödeme sistemi şeklinde iki eksene bağlı olarak uygulanmaktadır. Bunlardan şartlı muafiyet sistemi, serbest dolaşımda bulunmayan eşyanın Türkiye Gümrük Bölgesinde bir veya daha fazla işlem görmek üzere, gümrük vergilerine ve ticaret politikası önlemlerine tabi tutulmadan, alınması gereken vergileri teminata bağlanmak suretiyle geçici olarak ithali ve bu eşyanın işlem görmüş ürün şeklinde ihracı halinde teminatın iade edildiği sistemdir. Geri ödeme sistemi ise işleme faaliyetlerine tabi tutulmak amacıyla serbest dolaşıma giren eşyanın, işlem görmüş ürün olarak ihracı halinde, ödenen gümrük vergilerinin geri ödendiği sistemdir.