Konsey örgütün yürütme organıdır, daimîdir ve genel kurula karşı sorumludur. Yetki ve görevleri sadece genel kurulun kararlarını yerine getirmekten ibaret değildir, çeşitli yetkileri vardır. Konseyde üye olan devletlerdir. Gönderilen kişiler ise üye devlet temsilcisidirler. Üyeler üç yıl için genel kurul tarafından seçilir. Konsey başkanı, ICAO’ya dahil olup Konsey üyesi olan veya olmayan devletler tarafından gösterilen adaylar arasından Konsey tarafından seçilir. Ancak ICAO üyesi olmayan bir devlet vatandaşı başkan seçilemez. Başkan, Konseyin seçim devresi olan üç yıl için seçilir. Tekrar seçilmesi mümkündür. Başkanın görevi, Konsey tarafından belirlenen zamana, normal olarak yeni başkan seçilinceye kadar devam eder. Başkan Konsey tarafından her zaman görevden alınabilir. Konseydeki devlet temsilcilerinden biri başkan seçilirse boşalan yerine yeni bir temsilci göndermek
gerekir. Bu, başkan seçilen kişinin belirli bir devletin temsilcisi olmaktan çıktığını göstermektedir. Konsey karar verirken başkanın oy hakkı yoktur. Başkanın oy vermemesi,
görüşmeleri tarafsız bir şekilde daha iyi idare etmesine imkân verir. Başkanın üç görevi vardır: 1.Konseyi, hava seyrüsefer komisyonunu ve hava ulaştırma komitesini toplamak 2.Konseyi temsil etmek, 3.Konseyin kendine verdiği bütün işleri Konsey adına yapmak