Sanitasyon işlemleri ile hedeflenen amaçlar:
1. İnsan sağlığının korunması,
2. Gıda üretim tesislerinde sağlıklı ve kaliteli ürün elde edilmesi,
3. Çevrenin dengesinin korunması ve yaşanılabilir temiz bir çevrenin devamlılığının sağlanması,
4. İşletmelerde iş kazalarının azaltılması hatta önlenmesi, kaliteli üretim ve azami karlılık oranının arttırılması olarak sıralanabilir.