HACCP Uygulamasında 14 aşama vardır.
-Terimlerin ve amacın tanımlanması.
-HACCP ekibinin oluşturulması
-Ürünün tanımlanması
-Ürünün amaçlanan kullanımı
-Üretimin akış semasının oluşturulması: hasattan, işleme, dağıtım ve kullanıma kadar üretilen gıdayla ilgili bütün tehlike ve risklerin belirlenmesi, yani risk analizlerini içerir. Bunun için hammaddeden başlayarak tüketime kadar bütün aşamalar ayrıntılı bir şekilde akış semasında gösterilmektedir.
-Akış şemasının üretim hattında kontrolü.
-Tehlike analizi
-Kritik kontrol noktalarının saptanması
-Tanımlanan her bir kritik kontrol noktası için kullanılacak limit ve kontrol kriterlerinin belirlenmesi
-Kritik Kontrol Noktalarının ve Kriterlerin Kontrol ve İzlenmesi İçin Sistem Oluşturulması
-Gerekli olduğu durumlarda kritik kontrol noktalarında düzeltici önlemlerin alınması
-Kayıtların tutulması.
-Sistem etkinliğinin kanıtlanması
-HACCP planının gözden geçirilmesi.