Ribozomlar protein sentezinin yapıldığı organellerdir. Mitokondri, ökaryotik hücrelerin daimi organeli olan mitokondriler oksijenli solunumun (aerobik) yapıldığı kompartımanlardır Lizozom, protein, karbonhidrat ve yağlar gibi biyomolekülleri parçalayan enzimleri içerirler. Kloroplastlar bitki ve alglerde fotosentezin yapıldığı organeller olup yeşil bitkilerin yapraklarında çok sayıda bulunurlar. Golgi kompleksi, Salgı proteinlerinin işlenmesi ve paketlenmesinde ve kompleks polisakkaritlerin sentezinde önemli rolü vardır.