Proje aşamasında karşılaşılan sorunlar, danışmanlık sürecinde karşılaşılan sorunlar, işgören uyumsuzluğundan kaynaklanan sorunlar ve faaliyetlerin uluslararası düzeyde gerçekleşmesinden kaynaklanan sorunlar kurumsal kaynak planlamasının uygulanmasının yarattığı sorunlardandır. Uygulamanın sağladığı kar artışı, bu kapsamda bir sorun olarak değerlendirilemez.