ERP yazılım uygulamaları sırasında işletmelerde birtakım teknik sorunlarla da karşılaşılabilmektedir. Bu tür sorunlar genellikle, seçilen ERP yazılımının işletme hedefleri doğrultusunda kısa, orta, uzun dönemler için yapılan planları ve kullanılan iş süreçlerini karşılamadığı durumlarda ortaya çıkar. Eğer yazılım işletmesi, sorunun çözümüne bir katkı sağlamıyorsa bu durum ERP yazılımını uygulayan işletme için büyük zaman ve para kaybına yol açar.