Farenin yaşadığı kafes ortamı mikro çevreyi oluştururken; kafesin bulunduğu oda makro çevreyi ve bunları da kapsayan tüm bina mega çevreyi oluşturur. Kafes farenin yaşam alanını oluşturur ve boyutları, yapıldığı malzeme, kafesin altına yerleştirilen altlık materyali önemlidir. Kafesin yapıldığı malzemeler farelerin kemiremeyeceği, kimyasal ajanlara, deterjanla ra, suya ve ısıya dayanıklı olmalıdır. Dezenfekte edilebilen, hatta otoklavlanabilen özellikte olması idealdir. En çok tercih edilen polipropilen, polikarbonat, polietilen gibi materyallerdir. Kafeslerin taban kısımları da kullanım amacına göre farklılık gösterebilmektedir. Bazı kafeslerin alt kısmında takılıp çıkarılabilen ızgara ve plastik bir alt bulunur. Bu kafesler daha çok farenin kendi dışkısını yemesini engellemek için kullanılır. Günlük kullanım için uygun değildir. Fareler kafeslerde tek ya da grup halinde barındırılabilir; ancak sosyal hayvanlar olduğu için grup halinde barındırma tercih edilir. Gruplar, aynı cinste, yaşta ve ırkta olan bireylerden oluşturulur. Yavru fareler sütten kesildikten sonra ve ergin döneme ulaşmadan oluşturulmalıdır.