Uluslararası lojistik faaliyetlerinin yerine getirilmesinde, yerel ve bölgesel faaliyetlerin gerçekleştirilmesinde karşı karşıya kalınan bazı sorunların yanı sıra aşağıdaki sorunlarla da karşı karşıya gelinmektedir.

• Ortak planlama sorunları ve nitelikli ve deneyimli personelin yetersizliğinden kaynaklanan sorunlar,
• Ülkelere göre farklılık gösteren idari ve hukuki standart ve kısıtlamalar,
• Dil ve iletişim sorunları,
• Kültürel ve sosyal farklılıklar,
• Otomasyon sistemleri, elleçleme olanakları gibi donanım farklılıkları,
• Bankacılık ve kur işlemleri ve farklılıklar,
• Karşılıklı güvenden kaynaklanan sorunlar.