Çok türlü taşımacılığın temel dezavantajı birden fazla elleçleme yapmayı zorunlu kılmasıdır. “Taşıma zamanı ve mal güvenliği açısından hava şartlarından yüksek düzeyde etkilenmesi” deniz taşımacılığına ait dezavantajdır. “Mal hasar riskinin yüksek oluşu”, büyük ölçekli taşıma yapan deniz yolu taşımacılığına ait dezavantajdır. “Ürün çeşitliliğine izin vermeyen” ve “başlangıç ve bitiş noktalarında esneklik bulunmayan“ taşımacılık türü boru hattı taşımacılığıdır.