İç kontrolün diğer bir sınırlaması, oluşturulacak kontrollerde maliyet-kar dengesinin dikkate alınması zorunlu­luğudur. İç kontrol oluşturulurken, bir kontrol mekanizmasının yaratacağı faydanın maliyetini aşmaması gerekir. Eğer bir kontrol eyleminin faydası maliyetini aşıyor ise o kontrol eyleminin uygulanmasından vazgeçilir.