Hile yapılması iç kontrolü bozabilir. Yorgunluk ve uykusuzluk gibi insani zayıflıklar basit hatalara sebep olabilir.Karar verme sürecinde kişisel yargılar yanlışlıklara sebep olabilir. İç kontrolün diğer bir sınırlaması, oluşturulacak kontrollerde maliyet-kar dengesinin dikkate alınması zorunluluğudur. İç kontrol oluşturulurken, bir kontrol mekanizmasının yaratacağı faydanın maliyetini aşmaması gerekir. Eğer bir kontrol eyleminin faydası maliyetini aşıyor ise o kontrol eyleminin uygulanmasından vazgeçilir.