ÖYS’lerin diğer bilgi sistemleri ile entegrasyonunda dikkat edilmesi gereken konular bağlamında güvenlik ve performans olmak üzere iki ana başlık çıkmaktadır. ÖYS’lerde ve diğer bilgi sistemlerinde kişisel verilerin bulunduğu göz önüne alındığında entegre edilecek bilgi sisteminin kendisi ve ÖYS açısından güvenlik açığına neden olmaması son derece önemlidir.