Beyliğe ismini veren Germiyan’ın bir şahıs ismi mi yoksa aşiret adı mı olduğu bilinmediği gibi, Germiyanlıların menşei de tam olarak çözülememiştir. 13. Yüzyılın ilk yarısında Germiyanlı Türkmenleri Malatya civarında yurt tutmuşlardır. Nitekim 1239-1240 yıllarında Malatya’daki Germiyanlı aşiretinin reisi Muzafferüddin Alişir Bey, Selçuklu hizmetinde Babai isyan›n› bastırmakla görevlendirilmiş, ancak iki kez bu teşebbüsünde başarısız olmuştur.