İthalat ve ihracat vergilerinde Osmanlı üreticileri aleyhinde olan bu oranlar, sonraki dönemlerde anlaşmayı tartışmalı hale getirdi ve tartışmalar anlaşmanın Osmanlı sanayii için yıkıcı bir etki yaptığı noktasında yoğunlaştı. Ayrıca, İngiliz­ ler, İngilizce metinde olup Türkçe metinde bulunmayan “oradaki her türlü ticaret” ibaresini kullanarak ülkedeki iç ticarete de girdiler. Oysa o zamana kadar yabancı­ lar ülke içerisinde ticari faaliyette bulunamazlardı. Osmanlı hükümeti bu madde­ ye itiraz ettiyse de fiili durumu kabul etmek zorunda kaldı. Böylece yabancı tüccar iç ticarete girip büyük kazançlar elde ettiği gibi, kapitülasyonlara dayanarak devle­ tin denetimini, hukukunu ve kendilerini vergilendirmesini reddetti; bu durumda vergi veren ve devletin denetimine tabi olan yerli girişimcilerin yabancılarla reka­ bet imkânı ortadan kalktı.