Fonksiyonlara dayalı bölümlendirmenin  zayıf tarafı, bölüm yöneticileri kanalı ile iletişim öngörüldüğü için, iletişim ve dolayısıyla karar alma sürecinin ağır işlemesidir.

Her bölüm yöneticisi, sorunlara kendi açısından bakmaktadır.

Uygulamada en sık görülen fonksiyon temelli bölümlendirmede, her bölüm yöneticisi sadece kendi bölümünün faaliyetlerinden sorumlu olacaktır.

Fonksiyonlara göre bölümlendirmede işler ve görevler niteliklerine göre bir araya getirilmektedir.

Her fonksiyonel birimin alt fonksiyonlarının oluşturulmasında başka ölçütler kullanılamaz.