Vücut dengesinin korunmasında çevresel sistemlerle etkileşen merkezî ön beyin bölgesi hipotalamusdur. Talamusun altında bulunan hipotalamusun beyin sapı yapılarıyla yoğun etkileşimi bulunur. Hipotalamus aynı zamanda hormon salgılayan ana bez olan hipofiz bezi ile anatomik olarak bağlantılıdır. Hipotalamus, işlevsel açıdan özelleşmiş çok sayı- da çekirdekten oluşmuştur. En iyi tanımlanan işlevleri arasında; otonom sinir sisteminin, hormon sisteminin, vücut ısısının, vücut sıvı dengesinin ve biyolojik (sirkadyen) saatin kontrolü sayılabilir.