Retrospektif olduğu için kohort çalışmasına göre nedensellik ilişkinin kurulması daha zordur

Vakalar sadece sağlık kuruluşlarına başvuran kişiler arasından seçildiğinden, araştırma yapılan vakalar toplumdaki vakaların tamamını temsil etmeyebilir.

Vakaların etkene maruz kalmayı hatırlama olasılıkları kontrollerden daha yüksek olduğu için hatırlama yanlılığı vardır

Karıştırıcı değişkenlerin etkisini kontrol etmek zordur

Uygun bir kontrol grubu oluşturmak zor değildir