Tarımsal desteklemenin ve doğrudan gelir desteği sisteminin olumsuz yanlarından bazıları kısaca şöyledir:Kaliteli ürünler yanında kalitesiz ürünlerin de desteklenmesi üretime uygun olmayan yerlerde de üretim yapılmasına neden olmuştur. Kaliteli ve kalitesiz ürünlerin üretimine de aynı miktarda ödeme yapılması da çok büyük eleştiri almıştır.Doğrudan gelir desteği sistemi adaletsiz bir sistemdir. Çünkü bazı iller çok yüksek oranda destek alırken bazı iller ise çok düşük oranda doğrudan gelir desteği ödeneği alır.Doğrudan gelir desteği ödemeleri nerdeyse hiçbir zaman tam zamanında yapılamamıştır. Kaynak yetersizliğinden dolayı birçok ilde ödemelerin ancak yarısı yapılabilmektedir.Doğrudan gelir desteğine geçilmesiyle tarım üreticisine yapılan tarımsal desteklemelerde düşüş görülmüştür.Tüm üreticiler doğrudan gelir desteğinden yararlanamamaktadır. Özellikle,hayvancılıkla uğraşan tarım üreticileri doğrudan gelir desteğinden hiçbir şe-kilde faydalanamamaktadır. Dolayısıyla birçok üretici desteksiz kalmaktadır.