Mitakondri serbest oksijen radikallerinin en çok üretildiği ve hücre organelleri içinde reaktif oksijen türleri hasarına en çok uğrayan yaşlılık teorisidir. Hasara uğramış mitokondiriyal DNA ve diğer molekülleri nedeni ile ATP üretimi azalır ve azalmış ATP üretimi ise hücrede fonksiyon kaybına neden olarak yaşlanmaya neden olur.