Lizozomlar hücre içi sindirim sistemini oluştururlar. Hücreye alınan besin partiküllerini ve bakteri gibi istenmeyen maddeleri sindirirler. Lizozom içerisinde kırktan fazla enzim vardır. Etrafındaki membran, içerdiği hidrolitik enzimlerin hücreye zarar vermesini önler. Eğer lizozom membranı parçalanırsa bu enzimler hücreyi parçalarlar. Nötrofil, monosit gibi fagositoz yapan hücrelerde bolca bulunur. Doğumdan sonra uterusun, laktasyondan sonra süt bezlerinin küçülmesini, alçıya alınan kolun zayıflamasını lizozomların aktivitesine örnek verebiliriz. Yumurtanın döllenmesinde de lizozomlar yardımcı olur.