Eğer mutasyon, genin kodladığı proteinin yapısında veya fonksiyonunda herhangi bir değişiklik oluşturmuyorsa sessiz veya nötral mutasyon olarak isimlendirilir. Sessiz mutasyonlarda, gende oluşan bir bazlık değişim Wobble hipotezinden de hatırlayacağınız gibi aynı aminoasidi kodlayabileceğinden yine aynı amino asit üretimi ile sonuçlanmaktadır.