PCR ürünleri genellikle jel elektroforezi yoluyla görüntülenmektedir. Moleküllerin yük ve ağırlıklarına göre katettikleri mesafe de farklı olmaktadır. Diğer bir deyişle, düşük ağırlıklı moleküller ya da az baz çifti içerenler hızlı hareket ederken, büyük moleküller daha yavaş hareket etmektedirler.