Bakteriler gelişme için karbonun tek kaynağı olarak organik maddeler kullanırsa heterotrof, CO2 kullanırsa ototrof; elektron kaynağı olarak inorganik maddeler kullanırsa lithotrof, organik maddeler kullanırsa organotrof olarak isimlendirilmektedir. Paratrof mikroorganizmalar kendileri için gerekli enerjiyi konakçı hücrenin biyosentez olayları sonucu oluşan enerjiden sağlar.