Normal şora içinde bulunan apatojen bakterilerden bazıları konakçı direncinin bozulduğu durumlarda hastalığa sebep olabilir, bunlara da “fırsatçı patojen bakteriler”, “fakültatif patojenler” ya da “opportunist bakteriler” denir . Probiyotik bakteriler konağın sağlığına fayda sağlayan bakterilerdir. Simbiyoz, ortak yaşam demektir. Patojen bakteriler kesinlikle sağlıklı bireylerde şora etkenleri gibi normal olarak bulunmazlar ve sağlıklı bir bireye girdiklerinde infeksiyon ya da hastalık oluştururlar. Vektörler bulaşmada taşıyıcı görevi gören yapılardır.