Blokları oluşturan hastalıkların tek tek ele alındığı 3 basamaklı hastalık kodlarıdır. ICD-10’un temel çatısını bu 3 basamaklı hastalık kodları oluşturmaktadır (çekirdek sınıflandırma). Üçüncü düzeyde her hastalığa bir hastalık kodu karşılık gelir. Her bölümdeki 3 basamaklı hastalık kod sayısı birbirinden farklıdır. 

A00 Kolera 

A01 Tifo ve paratifo 

A02 Salmonella enfeksiyonları, diğer 

A03 Şigelloz 

A04 Bakteriyel barsak enfeksiyonları, diğer 

A05 Bakteriyel gıda zehirlenmeleri, diğer 

A06 Amibiyaz 

A07 Protozoal diğer barsak hastalıkları 

A08 Viral ve diğer tanımlanmış barsak enfeksiyonları