Medrese geleneği diğer İslam ülkelerinden ve Selçuklulardan kaynaklanır. Sinan da medrese yapılarını bu gelenek içinde tasarlasa da cami ile aynı avluyu paylaşan medreseler ve eğimli arazi üzerinde yer alan kademelenmiş medreseler Sinan’ın uyguladığı yeniliklerdir. Sinan’ın yaptığı bir diğer değişiklik dershanenin medrese odalarına birleşmeyip bir aralıkla ayrıldığı kompozisyonlardır.