İşletim maliyetleri operasyon için seçilen taşıma türüne göre farklılaşabilmektedir. Seçilen taşıma türünün karayolu taşımacılığı olması halinde personel (sürücü), vergi, sigorta vb. maliyetler söz konusu olurken denizyolu taşımacılığında; personel (mürettebat), vergi, sigorta, değer kaybı maliyeti, bakım-onarım maliyeti gibi maliyet kalemleri yer alabilmektedir.