Vergi uyuşmazlıklarında dava açılması kural olarak tahsilat işlemlerini durdurur; fakat bunun bir istisnası vardır. Amme Alacaklarının Tahsil Usulü Hakkındaki Kanun’a göre ödeme emirlerine karşı açılacak davalar tek başlarına işlemin yürütmesini durduramazlar. Ödeme emirlerinin herhangi bir sebeple iptali durumunda iptal hükmü ödeme emrinin düzenlendiği tarihten itibaren hüküm doğurur; yani ödeme emri hiç düzenlenmemiş sayılır. Ödeme emirlerine karşı açılacak davalar borcun tamamına karşı olabileceği gibi, açıkça belirtilmek koşuluyla borcun belirli bir kısmına ilişkin de olabilecektir. Borçlunun üst makamlara itirazı 7 günlük hak düşürücü süreyi durdurmayacak ve yine ödeme emrinde ödeme için 7 günden fazla bir süre verilmesi dava açmak için gerekli olan hak düşürücü süreyi değiştirmeyecektir.