Şeyhülislam Yahya’nın en önemli eseri divanıdır. Şeyhülislam Yahya Divanı geçen asrın basında Ibnülemin Mahmut Kemal’in sunusuyla eski harflerle (Istanbul 1334), daha sonra iki kez yeni harflerle basılır (Ertem 1995, Kavruk 2001). Divandan başka Yahya Efendi’nin fetvaları, Kaside-i Bürde’ye yazdığı Arapça tahmisi ve Kemal Pasazade’den tercüme ettiği Nigaristan adlı bir eseri vardır.