Çevresel belirsizliğin örgüt yapısı üzerindeki etkileri şöyledir:

• Bölümler arası farklılıklar artmaktadır. Her bölüm kendi fonksiyonel alanına yoğunlaşmakta ve örgütün bütününe ilişkin bakış açısını yitirmektedir.
• Örgütün koordinasyon ihtiyacı artmaktadır. Bölümler arası farklılıkların artması nedeniyle yatay ilişkilerin uyumlu hâle getirilmesi, yöneticilere ek sorumluluklar yüklemektedir.
• Örgüt çevreye uyum sağlayabilmelidir. Örgüt yapısı çevresel değişimlere hızlı bir şekilde cevap verebilecek esneklikte olmalıdır. Bu durum matriks yapıları, proje ekiplerini ve biçimsel olmayan örgütsel ilişkileri ön plana çıkartmaktadır.