Bünyesinde iş yapan örgütlerin, şebekenin bütüncül geleceğini değil de, kendi geleceklerini düşünmeleri tehlikesi, her zaman vardır. Örgütsel sınırların bulanıklaşması, yöneticilerin tüm şebekeyi ortak bir amaç etrafında birleştirme çabalarını oldukça zora sokmaktadır. Şebeke örgütlerde örgüt kültürü oldukça zayıftır.  Şebeke tipi örgütsel yapılanmaların denetimi zordur.